Prodotti

Riċentement irrappurtajna li n-nukleotide tal-pyrene huwa preferenzjali mdaħħal biswit sit bażiku, it-3'-T ta 'dimer tat-timina, u l-aktar bażijiet mhux imħassra minn DNA polymerase eta tal-ħmira (pol eta).Minħabba li pyrene hija molekula mhux polari bl-ebda kapaċità ta 'twaħħil ta' H, l-effiċjenzi għoljin mhux tas-soltu ta 'inserzjoni ta' dPMP huma attribwiti għall-kapaċità superjuri ta 'stacking tal-bażi tiegħu, u jenfasizzaw l-importanza ta' stacking bażi fl-għażla ta 'nukleotidi minn pol eta.Biex tinvestiga r-rwol tat-twaħħil H u l-ġeometrija tal-par bażi fl-għażla tan-nukleotidi mill-pol eta, iddeterminajna l-effiċjenzi tal-inserzjoni tan-nukleotidi modifikati b'bażi ​​2,6-diaminopurine, 2-aminopurine, 6-chloropurine, u inosine li kieku tagħmel numru differenti ta 'H-bonds mal-bażi tal-mudell skond il-ġeometrija tal-par bażi.It-tqabbil tal-bażi Watson-Crick jidher li għandu rwol importanti fl-għażla tal-analogi tan-nukleotidi għall-inserzjoni biswit C u T kif jidher mit-tnaqqis fl-effiċjenzi relattivi tal-inserzjoni bi tnaqqis fin-numru ta’ bonds Watson-Crick H u żieda fil- in-numru ta' interazzjonijiet donatur-donatur u aċċettatur-aċċettatur.Is-selettività tal-inserzjoni tan-nukleotide hija akbar bis-saħħa tal-5'-T milli t-3'-T tad-dimer tat-timina, skond ix-xogħol preċedenti li jissuġġerixxi li l-5'-T jinżamm b'mod aktar riġidu mit-3'-T.Barra minn hekk, l-inserzjoni ta’ A biswit iż-żewġ Ts tad-dimer tidher li hija medjata minn pairing tal-bażi Watson-Crick u mhux minn pairing tal-bażi Hoogsteen ibbażat fuq l-effiċjenzi ta’ inserzjoni kważi identiċi ta’ A u 7-deaza-A, li l-aħħar minnhom m’għandux H- kapaċità ta 'twaħħil f'N7.L-effiċjenzi relattivi għall-inserzjoni ta 'nukleotidi li jistgħu jiffurmaw pari ta' bażi Watson-Crick huma paralleli għal dawk għall-framment Klenow, filwaqt li l-framment Klenow jiddiskrimina b'mod aktar qawwi kontra t-tlaqqigħ, skond is-selettività akbar tal-forma tiegħu.Dawn ir-riżultati jenfasizzaw l-importanza tal-ġeometrija tal-pari ta’ bażi H-bonding u Watson-Crick fl-għażla tan-nukleotidi kemm mill-pol eta kif ukoll mill-framment Klen ow, u r-rwol inqas tal-għażla tal-forma fl-inserzjoni mill-pol eta minħabba l-aktar miftuħa u inqas tagħha. sit attiv ristrett.