Prodotti

Mogħdijiet molekulari patoġeniċi f'mard tal-fwied ċirrotiku bħall-virus tal-epatite Ċ (HCV), epatite awtoimmuni (AIH) u ċirrożi biljari primarja (PBC) huma kkaratterizzati ħażin.Ġeni espressi b'mod differenti ħafna drabi huma importanti fil-patoġenesi tal-mard.Soppressjoni ibridizzazzjoni sottrattiva (SSH) hija approċċ għall-ġenoma kollu li tarrikkixxi għal traskrizzjonijiet mRNA espressi b'mod differenzjali.Aħna immiraw li nagħmlu osservazzjonijiet ġodda ta 'espressjoni differenzjali tal-ġeni fiċ-ċirrożi bl-użu ta' SSH flimkien ma 'reazzjoni kwantitattiva f'ħin reali reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR).Traskriptomi tal-fwied f'ċirrożi HCV, ċirrożi AIH, PBC, u tessut tal-fwied mhux mordi ġew eżaminati minn SSH.Il-kloni komplementari tad-DNA (cDNA) riżultanti ġew eżaminati mill-ġdid għal espressjoni differenzjali permezz ta 'ibridizzazzjoni dot-blot u mbagħad sekwenzati.L-espressjoni tal-ġeni magħżula ġiet ikkwantifikata b'RT-PCR f'ħin reali.Wara SSH, 694 klonu ġew skrinjati mill-ġdid għall-espressjoni tal-ġeni differenzjali, li minnhom 145 ġew issekwenzjati u nstabu li ġejjin minn 89 ġene differenti.Seba' kloni kienu omologi biss b'sekwenzi ta' tikketta ta' sekwenza espressa (EST) li jikkodifikaw ġeni li ma kellhom l-ebda funzjoni magħrufa.Espressjoni up-regolata ta 'erba' ġeni ġiet ikkonfermata minn RT-PCR f'ħin reali: transmembrane 4 superfamily membru 3 (tetraspanin CO-029) fil-forom kollha ta 'ċirrożi, hedgehog interacting protein (HIP) f'AIH cirrhosis u chitinase 3-like-1 (HC gp-39 jew ykl-40) u aċidu arginine-glutamiku ripetut (RERE) fiċ-ċirrożi HCV.Polimorfiżmi tal-ġeni RERE u varjanti ta' splice ġew osservati fit-tessuti kollha eżaminati.Ir-regolamentazzjoni 'l fuq ta' Tetraspanin CO-029 kienet primarjament lokalizzata għal ċelluli tal-bili ductulari.Bħala konklużjoni, saru osservazzjonijiet ġodda ta 'espressjoni tal-ġeni differenzjali fiċ-ċirrożi tal-bniedem bl-użu ta' SSH bħala l-għodda ta 'skoperta primarja.B'mod partikolari, aktar studji tal-ġene RERE u l-prodotti tiegħu fil-mard tal-fwied assoċjat mal-HCV huma ġġustifikati.