Prodotti

Il-korriment tal-fwied ikkawżat mid-droga hija waħda mill-kawżi ewlenin tal-attrizzjoni tad-droga.Il-ħila li tbassar l-effetti tal-fwied tal-kandidati tad-droga mill-istrutturi kimiċi tagħhom hija kritika biex tgħin tiggwida proġetti sperimentali ta 'skoperta ta' drogi lejn mediċini aktar sikuri.F'dan l-istudju, kkumpilajna sett ta 'dejta ta' 951 kompost irrappurtat li jipproduċi firxa wiesgħa ta 'effetti fil-fwied fi speċi differenti, li jinkludu bnedmin, annimali gerriema u mhux gerriema.L-effetti tal-fwied għal dan is-sett tad-dejta nkisbu bħala metadejta asserzzjonali, ġġenerata minn astratti MEDLINE bl-użu ta 'kombinazzjoni unika ta' metodi lessikali u lingwistiċi u regoli ontoloġiċi.Aħna analizzajna dan is-sett ta 'dejta bl-użu ta' approċċi konvenzjonali tal-chemformatics u indirizzajna diversi mistoqsijiet li jappartjenu għal konkordanza bejn l-ispeċi tal-effetti tal-fwied, determinanti kimiċi tal-effetti tal-fwied fil-bnedmin, u t-tbassir ta 'jekk kompost partikolari x'aktarx jikkawża effett tal-fwied fil-bnedmin.Sibna li l-konkordanza tal-effetti tal-fwied kienet relattivament baxxa (ca. 39-44%) bejn speċi differenti, u qajjem il-possibbiltà li l-ispeċifiċità tal-ispeċi tista 'tiddependi fuq karatteristiċi speċifiċi tal-istruttura kimika.Il-komposti ġew miġbura mix-xebh kimiku tagħhom, u komposti simili ġew eżaminati għax-xebh mistenni tal-profili tal-effett tal-fwied tagħhom dipendenti mill-ispeċi.Fil-biċċa l-kbira tal-każijiet, profili simili ġew osservati għall-membri tal-istess cluster, iżda xi komposti dehru bħala outliers.L-outliers kienu s-suġġett ta' riġenerazzjoni ta' asserzjoni ffukata minn MEDLINE kif ukoll sorsi oħra ta' dejta.F'xi każijiet, ġew identifikati affermazzjonijiet bijoloġiċi addizzjonali, li kienu konformi mal-aspettattivi bbażati fuq ix-xebh kimiċi tal-komposti.L-asserzjonijiet ġew ikkonvertiti aktar għal annotazzjonijiet binarji ta 'kimiċi sottostanti (jiġifieri, effett tal-fwied vs l-ebda effett tal-fwied), u mudelli ta' relazzjoni ta 'struttura-attività kwantitattiva binarja (QSAR) ġew iġġenerati biex ibassru jekk kompost ikunx mistenni li jipproduċi effetti tal-fwied fil-bnedmin.Minkejja l-eteroġeneità apparenti t tad-dejta, il-mudelli wrew qawwa ta 'tbassir tajba evalwata minn proċeduri ta' validazzjoni inkroċjata ta '5 darbiet esterni.Il-qawwa ta 'tbassir esterna tal-mudelli QSAR binarji ġiet ikkonfermata aktar bl-applikazzjoni tagħhom għal komposti li ġew irkuprati jew studjati wara li l-mudell ġie żviluppat.Sa fejn nafu aħna, dan huwa l-ewwel studju għat-tbassir tat-tossiċità kimika li applika l-immudellar QSAR u tekniki oħra tal-kimformatika għal data ta’ osservazzjoni ġġenerata permezz ta’ tħaffir awtomatizzat tat-testi b’kura manwali limitata, li fetaħ opportunitajiet ġodda għall-ġenerazzjoni u l-immudellar tat-tossikoloġija kimika. data.